ある日、のび太はジャイアンとスネ夫から、コックリさんを使った怖い話を聞かされます。話を聞いたのび太は興味津々で、自分たちでもコックリさんを試してみたいと提案します。その後、のび太はしずかちゃんとドラえもんを誘って、放課後にコックリさんを行うことに決めました。
放課後、のび太たちは廃屋でコックリさんを始めます。しかし、彼らが呼び出そうとしたコックリさんは、何百年もの間封印されていた邪悪な力を持つ存在でした。その結果、彼らはその呪いを解くために、大冒険をすることになります。
封印から解放された邪悪なコックリさんは、まず町中の人々を操り始めます。そのせいで、町中では奇怪な現象が次々と起こり、住人たちは恐怖に陥ります。ドラえもんとのび太たちは、コックリさんの呪いを解くために、伝説の聖なるオブジェクトを求める旅に出ることを決意します。
彼らは様々な困難に直面しながらも、聖なるオブジェクトを見つける手がかりを追っていきます。旅を続けるうちに、彼らは過去の遺跡や幽霊の棲む森、果ては異次元空間に迷い込むことになります。この過程で、のび太たちはそれぞれ自分たちの勇気と友情を試される試練に立ち向かわなければなりません。
ついに、のび太たちは伝説の聖なるオブジェクトを手に入れることに成功します。しかし、邪悪なコックリさんは彼らを追い詰め、最後の戦いが始まります。この戦いの中で、ドラえもんは未来の道具を駆使してコックリさんと戦い、のび太たちは絆を強めていくことで、呪いに立ち向かいます。
激戦の末、のび太たちはついに邪悪なコックリさんを倒し、町に平和を取り戻すことに成功します。
